Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 AL355478.1-201ENST00000431686 821 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
MKRN3Q13064 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MKRN3Q13064 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
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