Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PTP4A2Q12974 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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PTP4A2Q12974 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTP4A2Q12974 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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