Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC10A2Q12908 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms