Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
KCNMA1Q12791 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KCNMA1Q12791 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms