Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SSRP1Q08945 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms