Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 DCAF12L1-201ENST00000371126 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 INTS13-201ENST00000261191 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 LINC02015-202ENST00000436078 2957 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 CDHR5-202ENST00000358353 3635 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 DGKA-202ENST00000394147 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CD300CQ08708 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms