Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DSC1Q08554 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.1 ms