Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBXN1Q04323 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms