Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms