Protein–RNA interactions for Protein: Q02161

RHD, Blood group Rh(D) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHDQ02161 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHDQ02161 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHDQ02161 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHDQ02161 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHDQ02161 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHDQ02161 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHDQ02161 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RHDQ02161 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHDQ02161 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHDQ02161 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHDQ02161 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHDQ02161 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHDQ02161 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHDQ02161 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHDQ02161 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHDQ02161 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHDQ02161 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHDQ02161 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHDQ02161 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHDQ02161 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHDQ02161 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHDQ02161 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHDQ02161 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHDQ02161 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHDQ02161 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHDQ02161 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHDQ02161 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHDQ02161 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHDQ02161 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHDQ02161 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHDQ02161 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHDQ02161 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHDQ02161 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHDQ02161 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHDQ02161 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHDQ02161 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHDQ02161 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHDQ02161 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHDQ02161 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RHDQ02161 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHDQ02161 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHDQ02161 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHDQ02161 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RHDQ02161 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHDQ02161 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHDQ02161 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHDQ02161 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHDQ02161 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHDQ02161 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHDQ02161 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHDQ02161 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RHDQ02161 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHDQ02161 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHDQ02161 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHDQ02161 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHDQ02161 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHDQ02161 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHDQ02161 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHDQ02161 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHDQ02161 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RHDQ02161 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHDQ02161 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHDQ02161 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHDQ02161 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHDQ02161 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHDQ02161 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHDQ02161 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHDQ02161 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHDQ02161 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHDQ02161 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHDQ02161 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHDQ02161 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHDQ02161 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHDQ02161 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHDQ02161 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHDQ02161 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RHDQ02161 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RHDQ02161 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHDQ02161 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RHDQ02161 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHDQ02161 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RHDQ02161 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHDQ02161 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHDQ02161 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHDQ02161 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHDQ02161 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHDQ02161 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHDQ02161 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHDQ02161 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHDQ02161 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RHDQ02161 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHDQ02161 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHDQ02161 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RHDQ02161 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHDQ02161 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHDQ02161 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHDQ02161 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHDQ02161 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHDQ02161 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RHDQ02161 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms