Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
XPCQ01831 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
XPCQ01831 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
XPCQ01831 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
XPCQ01831 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
XPCQ01831 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
XPCQ01831 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
XPCQ01831 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
XPCQ01831 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
XPCQ01831 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
XPCQ01831 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
XPCQ01831 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
XPCQ01831 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
XPCQ01831 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
XPCQ01831 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
XPCQ01831 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
XPCQ01831 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
XPCQ01831 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
XPCQ01831 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
XPCQ01831 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
XPCQ01831 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
XPCQ01831 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
XPCQ01831 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
XPCQ01831 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
XPCQ01831 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
XPCQ01831 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
XPCQ01831 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
XPCQ01831 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
XPCQ01831 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
XPCQ01831 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
XPCQ01831 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
XPCQ01831 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
XPCQ01831 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
XPCQ01831 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
XPCQ01831 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
XPCQ01831 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
XPCQ01831 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
XPCQ01831 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
XPCQ01831 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
XPCQ01831 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
XPCQ01831 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
XPCQ01831 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
XPCQ01831 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
XPCQ01831 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
XPCQ01831 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
XPCQ01831 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
XPCQ01831 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
XPCQ01831 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
XPCQ01831 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
XPCQ01831 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
XPCQ01831 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
XPCQ01831 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
XPCQ01831 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
XPCQ01831 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
XPCQ01831 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
XPCQ01831 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
XPCQ01831 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
XPCQ01831 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
XPCQ01831 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
XPCQ01831 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
XPCQ01831 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
XPCQ01831 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
XPCQ01831 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
XPCQ01831 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
XPCQ01831 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
XPCQ01831 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
XPCQ01831 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
XPCQ01831 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
XPCQ01831 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
XPCQ01831 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
XPCQ01831 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
XPCQ01831 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
XPCQ01831 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
XPCQ01831 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
XPCQ01831 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
XPCQ01831 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
XPCQ01831 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
XPCQ01831 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
XPCQ01831 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
XPCQ01831 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
XPCQ01831 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
XPCQ01831 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
XPCQ01831 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
XPCQ01831 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
XPCQ01831 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
XPCQ01831 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
XPCQ01831 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
XPCQ01831 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
XPCQ01831 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
XPCQ01831 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
XPCQ01831 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
XPCQ01831 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
XPCQ01831 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
XPCQ01831 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
XPCQ01831 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
XPCQ01831 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
XPCQ01831 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
XPCQ01831 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
XPCQ01831 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
XPCQ01831 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms