Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MC1RQ01726 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms