Protein–RNA interactions for Protein: P61601

NCALD, Neurocalcin-delta, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCALDP61601 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCALDP61601 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NCALDP61601 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NCALDP61601 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCALDP61601 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCALDP61601 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCALDP61601 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCALDP61601 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCALDP61601 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCALDP61601 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NCALDP61601 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCALDP61601 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NCALDP61601 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCALDP61601 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCALDP61601 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCALDP61601 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCALDP61601 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCALDP61601 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCALDP61601 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCALDP61601 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCALDP61601 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCALDP61601 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCALDP61601 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCALDP61601 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCALDP61601 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NCALDP61601 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCALDP61601 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCALDP61601 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCALDP61601 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCALDP61601 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCALDP61601 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCALDP61601 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCALDP61601 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCALDP61601 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCALDP61601 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCALDP61601 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCALDP61601 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCALDP61601 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCALDP61601 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCALDP61601 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCALDP61601 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCALDP61601 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NCALDP61601 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCALDP61601 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCALDP61601 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCALDP61601 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCALDP61601 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCALDP61601 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCALDP61601 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCALDP61601 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NCALDP61601 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCALDP61601 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCALDP61601 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCALDP61601 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCALDP61601 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCALDP61601 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCALDP61601 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCALDP61601 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCALDP61601 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCALDP61601 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCALDP61601 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCALDP61601 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NCALDP61601 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCALDP61601 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCALDP61601 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCALDP61601 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCALDP61601 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCALDP61601 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCALDP61601 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCALDP61601 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCALDP61601 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCALDP61601 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCALDP61601 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCALDP61601 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCALDP61601 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCALDP61601 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCALDP61601 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCALDP61601 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCALDP61601 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCALDP61601 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCALDP61601 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCALDP61601 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCALDP61601 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCALDP61601 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCALDP61601 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCALDP61601 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCALDP61601 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCALDP61601 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCALDP61601 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCALDP61601 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCALDP61601 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCALDP61601 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCALDP61601 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCALDP61601 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCALDP61601 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCALDP61601 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCALDP61601 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCALDP61601 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCALDP61601 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCALDP61601 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms