Protein–RNA interactions for Protein: P61578

ERVK-16, Endogenous retrovirus group K member 16 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-16P61578 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ERVK-16P61578 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms