Protein–RNA interactions for Protein: P61421

ATP6V0D1, V-type proton ATPase subunit d 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V0D1P61421 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP6V0D1P61421 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms