Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ACTBP60709 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ACTBP60709 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ACTBP60709 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ACTBP60709 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ACTBP60709 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ACTBP60709 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ACTBP60709 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ACTBP60709 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ACTBP60709 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ACTBP60709 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ACTBP60709 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ACTBP60709 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ACTBP60709 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ACTBP60709 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ACTBP60709 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ACTBP60709 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ACTBP60709 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ACTBP60709 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ACTBP60709 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ACTBP60709 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ACTBP60709 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ACTBP60709 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ACTBP60709 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ACTBP60709 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ACTBP60709 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ACTBP60709 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ACTBP60709 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ACTBP60709 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ACTBP60709 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ACTBP60709 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ACTBP60709 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ACTBP60709 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ACTBP60709 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ACTBP60709 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ACTBP60709 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ACTBP60709 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ACTBP60709 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ACTBP60709 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ACTBP60709 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ACTBP60709 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ACTBP60709 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ACTBP60709 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ACTBP60709 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ACTBP60709 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ACTBP60709 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ACTBP60709 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ACTBP60709 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ACTBP60709 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ACTBP60709 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ACTBP60709 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ACTBP60709 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ACTBP60709 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ACTBP60709 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ACTBP60709 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ACTBP60709 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ACTBP60709 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ACTBP60709 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ACTBP60709 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ACTBP60709 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ACTBP60709 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ACTBP60709 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ACTBP60709 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ACTBP60709 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ACTBP60709 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ACTBP60709 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ACTBP60709 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ACTBP60709 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ACTBP60709 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ACTBP60709 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ACTBP60709 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ACTBP60709 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ACTBP60709 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ACTBP60709 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ACTBP60709 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ACTBP60709 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ACTBP60709 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ACTBP60709 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ACTBP60709 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ACTBP60709 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTBP60709 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTBP60709 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTBP60709 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTBP60709 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTBP60709 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTBP60709 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTBP60709 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTBP60709 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTBP60709 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTBP60709 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTBP60709 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTBP60709 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTBP60709 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTBP60709 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTBP60709 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTBP60709 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTBP60709 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTBP60709 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTBP60709 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ACTBP60709 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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