Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MCCD1P59942 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms