Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDL3P58872 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms