Protein–RNA interactions for Protein: P57739

CLDN2, Claudin-2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN2P57739 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN2P57739 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms