Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGA8P53708 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA8P53708 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms