Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDST1P52848 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDST1P52848 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NDST1P52848 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDST1P52848 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDST1P52848 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDST1P52848 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDST1P52848 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDST1P52848 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDST1P52848 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDST1P52848 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDST1P52848 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDST1P52848 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDST1P52848 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDST1P52848 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDST1P52848 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDST1P52848 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDST1P52848 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDST1P52848 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDST1P52848 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDST1P52848 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDST1P52848 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDST1P52848 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDST1P52848 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDST1P52848 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDST1P52848 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDST1P52848 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDST1P52848 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NDST1P52848 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDST1P52848 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDST1P52848 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDST1P52848 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDST1P52848 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDST1P52848 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDST1P52848 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDST1P52848 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDST1P52848 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDST1P52848 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDST1P52848 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDST1P52848 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDST1P52848 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDST1P52848 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDST1P52848 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDST1P52848 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDST1P52848 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDST1P52848 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDST1P52848 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDST1P52848 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NDST1P52848 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDST1P52848 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDST1P52848 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDST1P52848 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDST1P52848 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDST1P52848 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDST1P52848 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDST1P52848 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDST1P52848 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDST1P52848 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDST1P52848 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDST1P52848 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDST1P52848 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDST1P52848 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDST1P52848 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDST1P52848 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDST1P52848 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDST1P52848 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDST1P52848 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDST1P52848 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDST1P52848 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDST1P52848 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDST1P52848 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDST1P52848 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDST1P52848 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDST1P52848 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDST1P52848 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDST1P52848 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDST1P52848 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDST1P52848 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDST1P52848 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDST1P52848 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDST1P52848 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDST1P52848 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDST1P52848 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDST1P52848 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDST1P52848 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDST1P52848 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDST1P52848 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDST1P52848 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDST1P52848 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDST1P52848 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDST1P52848 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDST1P52848 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NDST1P52848 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDST1P52848 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDST1P52848 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDST1P52848 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDST1P52848 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NDST1P52848 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDST1P52848 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDST1P52848 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms