Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FNTBP49356 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FNTBP49356 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FNTBP49356 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FNTBP49356 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FNTBP49356 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FNTBP49356 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FNTBP49356 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTBP49356 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTBP49356 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTBP49356 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTBP49356 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTBP49356 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTBP49356 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTBP49356 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTBP49356 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTBP49356 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTBP49356 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTBP49356 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTBP49356 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTBP49356 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTBP49356 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTBP49356 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTBP49356 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTBP49356 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTBP49356 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTBP49356 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTBP49356 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTBP49356 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTBP49356 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTBP49356 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTBP49356 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTBP49356 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTBP49356 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTBP49356 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTBP49356 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTBP49356 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTBP49356 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTBP49356 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTBP49356 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTBP49356 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTBP49356 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTBP49356 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTBP49356 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTBP49356 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTBP49356 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTBP49356 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTBP49356 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTBP49356 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTBP49356 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTBP49356 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTBP49356 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTBP49356 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTBP49356 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTBP49356 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNTBP49356 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTBP49356 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTBP49356 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTBP49356 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTBP49356 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTBP49356 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTBP49356 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTBP49356 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTBP49356 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTBP49356 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTBP49356 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTBP49356 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTBP49356 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTBP49356 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTBP49356 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTBP49356 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTBP49356 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTBP49356 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTBP49356 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTBP49356 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTBP49356 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTBP49356 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTBP49356 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTBP49356 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTBP49356 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTBP49356 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTBP49356 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTBP49356 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTBP49356 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTBP49356 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTBP49356 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTBP49356 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTBP49356 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTBP49356 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTBP49356 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTBP49356 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTBP49356 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTBP49356 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTBP49356 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNTBP49356 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTBP49356 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTBP49356 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTBP49356 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTBP49356 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FNTBP49356 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms