Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CHRNA4P43681 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA4P43681 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.5 ms