Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIA2P42262 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms