Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTR1BP42025 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms