Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PBX2P40425 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PBX2P40425 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PBX2P40425 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PBX2P40425 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PBX2P40425 C20orf85-201ENST00000371168 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PBX2P40425 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PBX2P40425 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PBX2P40425 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PBX2P40425 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PBX2P40425 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PBX2P40425 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PBX2P40425 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PBX2P40425 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PBX2P40425 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PBX2P40425 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PBX2P40425 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PBX2P40425 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PBX2P40425 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PBX2P40425 MAP3K14-205ENST00000617331 1049 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PBX2P40425 AC027281.2-201ENST00000623856 713 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PBX2P40425 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PBX2P40425 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PBX2P40425 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PBX2P40425 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PBX2P40425 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PBX2P40425 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PBX2P40425 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PBX2P40425 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PBX2P40425 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PBX2P40425 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PBX2P40425 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PBX2P40425 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PBX2P40425 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PBX2P40425 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PBX2P40425 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PBX2P40425 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PBX2P40425 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PBX2P40425 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PBX2P40425 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PBX2P40425 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PBX2P40425 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PBX2P40425 PMCHL1-203ENST00000423301 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PBX2P40425 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PBX2P40425 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PBX2P40425 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PBX2P40425 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PBX2P40425 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PBX2P40425 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PBX2P40425 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PBX2P40425 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PBX2P40425 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PBX2P40425 AC133485.6-201ENST00000624045 688 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PBX2P40425 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PBX2P40425 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PBX2P40425 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PBX2P40425 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PBX2P40425 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PBX2P40425 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PBX2P40425 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PBX2P40425 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PBX2P40425 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PBX2P40425 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PBX2P40425 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PBX2P40425 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PBX2P40425 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PBX2P40425 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PBX2P40425 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PBX2P40425 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PBX2P40425 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PBX2P40425 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PBX2P40425 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PBX2P40425 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PBX2P40425 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PBX2P40425 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PBX2P40425 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PBX2P40425 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PBX2P40425 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PBX2P40425 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PBX2P40425 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PBX2P40425 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PBX2P40425 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PBX2P40425 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PBX2P40425 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PBX2P40425 SMIM11A-201ENST00000399292 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PBX2P40425 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PBX2P40425 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PBX2P40425 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PBX2P40425 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PBX2P40425 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PBX2P40425 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PBX2P40425 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PBX2P40425 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PBX2P40425 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PBX2P40425 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PBX2P40425 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PBX2P40425 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PBX2P40425 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PBX2P40425 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PBX2P40425 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms