Protein–RNA interactions for Protein: P37235

HPCAL1, Hippocalcin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAL1P37235 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HPCAL1P37235 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HPCAL1P37235 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HPCAL1P37235 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HPCAL1P37235 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
HPCAL1P37235 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HPCAL1P37235 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HPCAL1P37235 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HPCAL1P37235 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HPCAL1P37235 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HPCAL1P37235 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HPCAL1P37235 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
HPCAL1P37235 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HPCAL1P37235 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HPCAL1P37235 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HPCAL1P37235 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HPCAL1P37235 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HPCAL1P37235 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HPCAL1P37235 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HPCAL1P37235 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HPCAL1P37235 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HPCAL1P37235 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HPCAL1P37235 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HPCAL1P37235 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HPCAL1P37235 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HPCAL1P37235 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HPCAL1P37235 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HPCAL1P37235 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HPCAL1P37235 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HPCAL1P37235 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HPCAL1P37235 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HPCAL1P37235 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HPCAL1P37235 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HPCAL1P37235 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HPCAL1P37235 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HPCAL1P37235 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HPCAL1P37235 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HPCAL1P37235 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
HPCAL1P37235 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HPCAL1P37235 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HPCAL1P37235 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HPCAL1P37235 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HPCAL1P37235 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HPCAL1P37235 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HPCAL1P37235 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HPCAL1P37235 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HPCAL1P37235 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HPCAL1P37235 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HPCAL1P37235 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HPCAL1P37235 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HPCAL1P37235 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HPCAL1P37235 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HPCAL1P37235 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HPCAL1P37235 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HPCAL1P37235 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HPCAL1P37235 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HPCAL1P37235 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HPCAL1P37235 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HPCAL1P37235 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HPCAL1P37235 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HPCAL1P37235 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HPCAL1P37235 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HPCAL1P37235 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HPCAL1P37235 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HPCAL1P37235 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HPCAL1P37235 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HPCAL1P37235 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HPCAL1P37235 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HPCAL1P37235 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HPCAL1P37235 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HPCAL1P37235 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HPCAL1P37235 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HPCAL1P37235 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HPCAL1P37235 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HPCAL1P37235 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HPCAL1P37235 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HPCAL1P37235 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HPCAL1P37235 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HPCAL1P37235 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HPCAL1P37235 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HPCAL1P37235 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HPCAL1P37235 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HPCAL1P37235 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HPCAL1P37235 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
HPCAL1P37235 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HPCAL1P37235 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HPCAL1P37235 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HPCAL1P37235 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HPCAL1P37235 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HPCAL1P37235 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HPCAL1P37235 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HPCAL1P37235 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HPCAL1P37235 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HPCAL1P37235 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HPCAL1P37235 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HPCAL1P37235 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HPCAL1P37235 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HPCAL1P37235 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HPCAL1P37235 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HPCAL1P37235 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms