Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM23P36406 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms