Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXD13P35453 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms