Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GTF2E2P29084 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GTF2E2P29084 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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