Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB2P29033 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB2P29033 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB2P29033 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB2P29033 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB2P29033 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB2P29033 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB2P29033 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB2P29033 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB2P29033 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB2P29033 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB2P29033 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB2P29033 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB2P29033 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB2P29033 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB2P29033 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB2P29033 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB2P29033 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB2P29033 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB2P29033 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB2P29033 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB2P29033 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB2P29033 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB2P29033 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB2P29033 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB2P29033 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB2P29033 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB2P29033 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB2P29033 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB2P29033 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB2P29033 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB2P29033 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB2P29033 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB2P29033 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB2P29033 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB2P29033 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB2P29033 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB2P29033 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB2P29033 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB2P29033 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB2P29033 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB2P29033 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB2P29033 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB2P29033 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB2P29033 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GJB2P29033 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB2P29033 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB2P29033 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB2P29033 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB2P29033 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB2P29033 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB2P29033 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB2P29033 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB2P29033 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB2P29033 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB2P29033 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB2P29033 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB2P29033 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB2P29033 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB2P29033 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB2P29033 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB2P29033 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB2P29033 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB2P29033 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB2P29033 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB2P29033 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB2P29033 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB2P29033 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB2P29033 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB2P29033 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB2P29033 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB2P29033 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB2P29033 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB2P29033 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB2P29033 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB2P29033 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB2P29033 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB2P29033 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB2P29033 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB2P29033 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB2P29033 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GJB2P29033 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB2P29033 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB2P29033 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB2P29033 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB2P29033 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB2P29033 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB2P29033 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB2P29033 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB2P29033 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB2P29033 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB2P29033 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB2P29033 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB2P29033 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB2P29033 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB2P29033 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB2P29033 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB2P29033 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB2P29033 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GJB2P29033 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms