Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PLNP26678 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PLNP26678 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PLNP26678 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PLNP26678 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PLNP26678 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PLNP26678 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PLNP26678 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PLNP26678 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PLNP26678 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PLNP26678 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PLNP26678 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PLNP26678 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PLNP26678 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PLNP26678 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PLNP26678 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PLNP26678 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PLNP26678 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PLNP26678 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PLNP26678 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PLNP26678 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PLNP26678 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PLNP26678 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PLNP26678 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PLNP26678 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PLNP26678 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PLNP26678 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms