Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO2P25791 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO2P25791 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO2P25791 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO2P25791 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO2P25791 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO2P25791 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO2P25791 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO2P25791 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO2P25791 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO2P25791 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO2P25791 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO2P25791 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO2P25791 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO2P25791 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO2P25791 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO2P25791 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO2P25791 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO2P25791 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO2P25791 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO2P25791 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO2P25791 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO2P25791 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO2P25791 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO2P25791 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO2P25791 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO2P25791 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO2P25791 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO2P25791 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO2P25791 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO2P25791 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO2P25791 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO2P25791 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO2P25791 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO2P25791 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO2P25791 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO2P25791 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO2P25791 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO2P25791 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO2P25791 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO2P25791 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO2P25791 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO2P25791 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO2P25791 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO2P25791 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO2P25791 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO2P25791 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO2P25791 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMO2P25791 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO2P25791 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO2P25791 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO2P25791 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO2P25791 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO2P25791 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO2P25791 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO2P25791 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO2P25791 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO2P25791 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO2P25791 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO2P25791 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO2P25791 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO2P25791 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO2P25791 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO2P25791 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO2P25791 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO2P25791 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO2P25791 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO2P25791 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO2P25791 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO2P25791 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO2P25791 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO2P25791 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO2P25791 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO2P25791 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO2P25791 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO2P25791 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO2P25791 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO2P25791 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO2P25791 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO2P25791 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO2P25791 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO2P25791 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO2P25791 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO2P25791 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMO2P25791 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LMO2P25791 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
LMO2P25791 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
LMO2P25791 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LMO2P25791 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO2P25791 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO2P25791 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO2P25791 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO2P25791 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO2P25791 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO2P25791 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO2P25791 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO2P25791 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO2P25791 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO2P25791 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMO2P25791 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms