Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP5F1P24539 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms