Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRGP23470 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
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