Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PTPRDP23468 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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