Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HOXA5P20719 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms