Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM21P19474 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms