Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATF3P18847 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATF3P18847 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATF3P18847 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATF3P18847 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATF3P18847 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATF3P18847 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATF3P18847 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATF3P18847 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATF3P18847 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATF3P18847 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATF3P18847 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATF3P18847 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATF3P18847 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATF3P18847 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATF3P18847 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATF3P18847 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATF3P18847 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATF3P18847 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATF3P18847 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATF3P18847 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATF3P18847 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATF3P18847 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATF3P18847 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATF3P18847 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATF3P18847 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATF3P18847 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATF3P18847 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATF3P18847 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATF3P18847 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATF3P18847 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATF3P18847 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATF3P18847 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATF3P18847 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATF3P18847 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATF3P18847 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATF3P18847 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATF3P18847 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATF3P18847 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATF3P18847 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATF3P18847 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATF3P18847 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATF3P18847 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATF3P18847 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATF3P18847 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATF3P18847 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATF3P18847 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATF3P18847 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATF3P18847 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATF3P18847 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATF3P18847 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATF3P18847 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATF3P18847 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATF3P18847 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATF3P18847 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATF3P18847 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATF3P18847 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATF3P18847 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATF3P18847 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATF3P18847 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATF3P18847 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATF3P18847 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATF3P18847 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATF3P18847 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATF3P18847 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATF3P18847 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ATF3P18847 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATF3P18847 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ATF3P18847 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATF3P18847 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ATF3P18847 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATF3P18847 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATF3P18847 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATF3P18847 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATF3P18847 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ATF3P18847 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATF3P18847 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATF3P18847 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATF3P18847 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATF3P18847 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATF3P18847 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ATF3P18847 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATF3P18847 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATF3P18847 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATF3P18847 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATF3P18847 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATF3P18847 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATF3P18847 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATF3P18847 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATF3P18847 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATF3P18847 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATF3P18847 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATF3P18847 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ATF3P18847 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATF3P18847 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATF3P18847 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATF3P18847 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATF3P18847 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATF3P18847 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATF3P18847 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms