Protein–RNA interactions for Protein: P18669

PGAM1, Phosphoglycerate mutase 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM1P18669 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGAM1P18669 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGAM1P18669 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PGAM1P18669 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGAM1P18669 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGAM1P18669 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGAM1P18669 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGAM1P18669 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGAM1P18669 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PGAM1P18669 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PGAM1P18669 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PGAM1P18669 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms