Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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