Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
IFITM1P13164 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms