Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHGAP10645 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHGAP10645 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHGAP10645 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHGAP10645 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHGAP10645 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHGAP10645 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHGAP10645 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CHGAP10645 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHGAP10645 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHGAP10645 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHGAP10645 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CHGAP10645 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHGAP10645 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHGAP10645 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHGAP10645 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHGAP10645 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHGAP10645 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHGAP10645 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHGAP10645 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHGAP10645 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHGAP10645 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHGAP10645 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHGAP10645 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHGAP10645 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHGAP10645 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHGAP10645 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHGAP10645 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHGAP10645 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHGAP10645 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHGAP10645 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHGAP10645 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHGAP10645 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHGAP10645 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHGAP10645 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHGAP10645 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHGAP10645 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHGAP10645 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHGAP10645 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHGAP10645 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHGAP10645 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHGAP10645 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHGAP10645 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHGAP10645 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHGAP10645 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHGAP10645 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHGAP10645 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHGAP10645 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHGAP10645 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHGAP10645 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHGAP10645 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHGAP10645 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHGAP10645 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHGAP10645 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHGAP10645 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHGAP10645 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHGAP10645 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHGAP10645 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHGAP10645 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHGAP10645 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHGAP10645 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHGAP10645 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CHGAP10645 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CHGAP10645 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHGAP10645 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CHGAP10645 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CHGAP10645 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHGAP10645 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHGAP10645 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHGAP10645 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHGAP10645 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHGAP10645 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CHGAP10645 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHGAP10645 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHGAP10645 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHGAP10645 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHGAP10645 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHGAP10645 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHGAP10645 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHGAP10645 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHGAP10645 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHGAP10645 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHGAP10645 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHGAP10645 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHGAP10645 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHGAP10645 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CHGAP10645 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHGAP10645 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHGAP10645 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHGAP10645 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHGAP10645 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHGAP10645 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHGAP10645 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHGAP10645 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHGAP10645 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CHGAP10645 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHGAP10645 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CHGAP10645 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHGAP10645 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CHGAP10645 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms