Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC172P0C7W6 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms