Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SRPRAP08240 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SRPRAP08240 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
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