Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOP08100 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOP08100 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOP08100 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOP08100 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOP08100 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOP08100 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOP08100 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOP08100 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOP08100 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOP08100 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOP08100 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOP08100 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOP08100 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOP08100 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOP08100 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOP08100 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOP08100 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOP08100 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOP08100 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOP08100 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOP08100 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOP08100 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOP08100 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOP08100 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOP08100 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOP08100 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOP08100 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOP08100 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOP08100 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOP08100 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOP08100 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOP08100 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOP08100 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOP08100 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOP08100 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOP08100 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOP08100 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOP08100 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOP08100 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOP08100 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOP08100 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOP08100 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOP08100 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOP08100 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOP08100 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOP08100 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOP08100 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOP08100 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOP08100 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOP08100 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOP08100 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOP08100 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOP08100 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOP08100 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOP08100 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOP08100 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOP08100 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOP08100 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOP08100 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOP08100 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOP08100 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOP08100 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOP08100 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOP08100 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOP08100 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOP08100 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOP08100 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOP08100 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOP08100 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOP08100 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOP08100 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOP08100 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOP08100 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOP08100 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOP08100 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOP08100 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOP08100 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOP08100 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOP08100 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOP08100 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOP08100 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOP08100 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOP08100 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOP08100 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOP08100 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOP08100 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOP08100 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOP08100 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOP08100 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOP08100 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOP08100 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOP08100 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOP08100 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOP08100 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOP08100 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOP08100 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOP08100 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOP08100 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHOP08100 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms