Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYBBP04839 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYBBP04839 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYBBP04839 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYBBP04839 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYBBP04839 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYBBP04839 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYBBP04839 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYBBP04839 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYBBP04839 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYBBP04839 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYBBP04839 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYBBP04839 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYBBP04839 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYBBP04839 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYBBP04839 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYBBP04839 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYBBP04839 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYBBP04839 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYBBP04839 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYBBP04839 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CYBBP04839 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYBBP04839 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYBBP04839 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYBBP04839 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYBBP04839 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CYBBP04839 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYBBP04839 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYBBP04839 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYBBP04839 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYBBP04839 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CYBBP04839 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYBBP04839 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYBBP04839 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CYBBP04839 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYBBP04839 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CYBBP04839 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CYBBP04839 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CYBBP04839 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYBBP04839 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYBBP04839 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYBBP04839 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYBBP04839 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYBBP04839 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYBBP04839 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYBBP04839 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYBBP04839 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CYBBP04839 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYBBP04839 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYBBP04839 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYBBP04839 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYBBP04839 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYBBP04839 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYBBP04839 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYBBP04839 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYBBP04839 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYBBP04839 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYBBP04839 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYBBP04839 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYBBP04839 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYBBP04839 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYBBP04839 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYBBP04839 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYBBP04839 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CYBBP04839 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYBBP04839 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYBBP04839 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYBBP04839 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYBBP04839 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYBBP04839 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYBBP04839 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYBBP04839 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYBBP04839 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CYBBP04839 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYBBP04839 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYBBP04839 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYBBP04839 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYBBP04839 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYBBP04839 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYBBP04839 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYBBP04839 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYBBP04839 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYBBP04839 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYBBP04839 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYBBP04839 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYBBP04839 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYBBP04839 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYBBP04839 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYBBP04839 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYBBP04839 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYBBP04839 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYBBP04839 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYBBP04839 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYBBP04839 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYBBP04839 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYBBP04839 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYBBP04839 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYBBP04839 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYBBP04839 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYBBP04839 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms