Protein–RNA interactions for Protein: P01127

PDGFB, Platelet-derived growth factor subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 241 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFBP01127 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDGFBP01127 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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