Protein–RNA interactions for Protein: O95428

PAPLN, Papilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPLNO95428 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PAPLNO95428 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms