Protein–RNA interactions for Protein: O95389

WISP3, WNT1-inducible-signaling pathway protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WISP3O95389 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WISP3O95389 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WISP3O95389 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WISP3O95389 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WISP3O95389 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WISP3O95389 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WISP3O95389 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WISP3O95389 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WISP3O95389 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WISP3O95389 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
WISP3O95389 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WISP3O95389 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WISP3O95389 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WISP3O95389 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WISP3O95389 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WISP3O95389 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WISP3O95389 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WISP3O95389 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WISP3O95389 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WISP3O95389 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WISP3O95389 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WISP3O95389 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WISP3O95389 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WISP3O95389 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WISP3O95389 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WISP3O95389 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WISP3O95389 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WISP3O95389 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WISP3O95389 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WISP3O95389 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WISP3O95389 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WISP3O95389 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WISP3O95389 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
WISP3O95389 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
WISP3O95389 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WISP3O95389 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
WISP3O95389 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
WISP3O95389 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
WISP3O95389 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
WISP3O95389 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
WISP3O95389 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
WISP3O95389 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
WISP3O95389 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
WISP3O95389 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
WISP3O95389 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
WISP3O95389 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
WISP3O95389 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
WISP3O95389 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
WISP3O95389 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
WISP3O95389 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
WISP3O95389 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
WISP3O95389 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
WISP3O95389 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
WISP3O95389 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
WISP3O95389 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
WISP3O95389 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
WISP3O95389 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
WISP3O95389 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
WISP3O95389 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
WISP3O95389 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
WISP3O95389 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
WISP3O95389 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
WISP3O95389 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
WISP3O95389 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
WISP3O95389 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
WISP3O95389 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
WISP3O95389 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
WISP3O95389 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
WISP3O95389 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
WISP3O95389 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
WISP3O95389 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
WISP3O95389 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
WISP3O95389 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
WISP3O95389 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
WISP3O95389 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
WISP3O95389 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
WISP3O95389 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
WISP3O95389 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
WISP3O95389 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
WISP3O95389 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
WISP3O95389 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
WISP3O95389 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
WISP3O95389 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
WISP3O95389 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
WISP3O95389 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
WISP3O95389 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
WISP3O95389 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
WISP3O95389 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
WISP3O95389 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
WISP3O95389 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
WISP3O95389 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
WISP3O95389 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
WISP3O95389 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
WISP3O95389 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
WISP3O95389 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
WISP3O95389 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
WISP3O95389 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
WISP3O95389 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
WISP3O95389 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
WISP3O95389 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms